為改善組織結構，提高參政議政水平和為經濟建設服務能力，近年來，省委會把在高等院校發展會員、建立組織作為組織建設中一項重要工作來抓。2001年、2003年先后召開在杭主要高校統戰聯誼座談會，加強與各高校的聯系溝通，逐步形成共識。在各高校黨委部門的支持、幫助下，這幾年我會在省屬高校發展了一批素質較高的會員，他們多數有高級職稱或研究生以上學歷，在本職工作中取得較好成績，為會輸入了新鮮血液，增強了后勁。目前，在省屬高校的會員除立足本職，積極參與學校的改革發展，受到各高校黨委部門的認同外，還通過各種渠道積極履行參政黨職能，成為省委會參政議政的一支重要力量。
2003年12月16日，民建杭州商學院支部成立。這是我會建立的又一個省屬院校支部。杭商院黨委副書記廖日文、統戰部長及各黨派代表到會祝賀。省委會副主委郭吉豐代表省委會參加會議并致賀詞。會議選舉錢水土為支部主任，王寶慶為支部副主任。
12月23日，民建浙江大學總支部成立。目前，我會在浙大除玉泉校區外，在另外三個校區也相繼發展了一些成員。為便于開展活動、加強組織建設、更好地圍繞各校區工作建言獻策，這次借浙大支部換屆之際，在原浙大支部的基礎上成立了浙大總支，下設二個支部。浙江大學黨委副書記龐學銓、統戰部長及兄弟黨派代表到會祝賀，民建省屬各支部也發來賀信。省委會主委吳國華代表省委會出席會議，并作了講話。吳主委充分肯定浙大支部近年來在加強思想建設、組織建設和履行黨派職能方面取得的成績。指出2004年我會工作重點是加強基層組織建設，希望按照把基層組織真正建設成為"自我教育的學校，參政議政的橋梁，團結互助的集體，培養人才的基地"的要求來組建、發展和完善基層組織，積極探索新形勢下搞好基層組織建設的途徑、方法，走出一條行之有效的路子。會議選舉郭吉豐為總支主任，鄭明川為總支副主任，王紫雯、張英、謝關林為總支委員，同時選舉產生了下設的二個支部的班子成員。
杭商院支部及浙大總支的成立，為我會在省屬高校的組織建設翻開新的一頁。這與兩所院校黨委部門的支持分不開，更與會員們的努力分不開。正如兩校領導在賀詞中說的那樣，民建在學校的會員人數雖不多，但素質好，教學科研、參政議政的熱情和水平較高，取得可喜成績。相信民建杭商院支部、浙大總支及支部在班子成員的帶領下，在學校黨委統戰部門的關心支持下，在省委會、省屬工委的領導幫助下，會不斷加強自身建設，提高參政議政水平，發揮會員專長，形成合力，使參政黨基層組織的作用進一步得到發揮。