目前我市在與水有關的行政管理方面，存在著多頭管理問題，形象地說，是“六龍治水”；錢塘江由省錢塘江管理局管理；運河由市運河管理處管理；地下水(包括礦泉水)由市國土資源局管理；農村水利由市林水局管理：城市河道由市城鄉建委管理；排污由市環保局管理。這種多頭管理現狀雖有其歷史的合理性，但勿庸諱言，也確有其局限性。比如：政策難以協調；部門之間有權力、利益之爭；對水務管理的認識水平難以提高；管理上存在漏洞等。
眾所周知，水是一種流動性的、流域性的、互通性的存在物，對它的管理權，不應該分割，而應以統一的、集中式的為宜。水還是一種人們生活、生產所不可或缺的資源。在實施可持續戰略、走新型工業化之路的今天，在對水的認識上，應樹立“水經濟”和“水工業”的先進理念。現代水經濟是對水進行投入，進行保護性、改善性的經營，注重節約和可持續利用，同時引入市場經濟。其定義是：水經濟是建立在可持續發展基礎上．依托水資源，將治水、護水與開發水相協調而發展起來的經濟。水工業理念亦主張將給水與排水作為統一體，以融入高新技術的水質處理為核心內容，從而實現水資源的可持續發 展，并提供各種供水服務。這兩個理念，都要求對水務進行統一管理。
當前，我市正致力于建設效能政府，所以無論從目前杭州水務管理的局限，還是從水資源的性質和水經濟發展的要求來看，都有必要在我市設立水務局，對水務進行統籌管理，行使統一的管理權。從已成立水務局的一些地方如上海、本省的金華等地的實施情況來看， 成立水務局后，對水務的管理比以前順暢，工作效率也提高了。
考慮到機構精簡問題，設立市水務局時，原有水務管理機構的業務和人員應予撤并。市林水局將不再管理農村水利；市運河管理處成建制并入水務局；市城鄉建委不再管理城市河道；市環保局也將不負責排污管理。
借鑒外地沒立水務局的成功經驗，我們建議新成立的杭州市水務局的主要職責是：
1、貫徹執行有關水行政工作的方針，政策和法律、法規，規章；結合本市實際，研究起草水行政工作的地方性規章和政策。
2，根據本市國民經濟和社會發展總體規劃，組織編制本市水利工作發展規劃、中長期計劃和年度計劃，并組織實施。
3、統一管理本市水資源(含空中水、地表水、地下水)；制定水資源中長期供求汁劃、水量分配調度方案并監督實施；組織實施取水許可證制度和水資源費征收工作；發布水資源公告；負責計劃用水工作，組織、指導和監督節約用水工作；負責水行業的管理；負責水文工作。 　　4、主管防汛抗旱工作，承擔市防汛抗旱指揮部的日常工作。
5、負責排水與污水處理設施的建設、管理和排水費征收工作，組織實施排水許可證制度，負責排水行業的管理。 　　6、主管本市河道(包括人工水道)、湖泊、水庫、江海堤防，并組織整治；負責錢塘江流域杭州部分的開發整治。 　　7、組織實施水行政監察工作和水行政執法；協調部門間和區、縣(市)間的水事糾紛。
8、主管各類水利工程；負責組織和協調城市建設中涉及水利設施的配套工作。
9、指導農村水利工作，組織、協調農田水利基本建設，會同有關部門實施水地保持工作。